Perairan pedalaman menyokong biodiversiti akuatik yang kaya yang menempati hampir 2 juta kilometer persegi di rantau ASEAN, dan ini menjadikan perairan pedalaman antara habitat semula jadi yang paling pelbagai dan produktif. Perairan pedalaman menyokong beberapa komponen biodiversiti akuatik termasuk reptilia, amfibia, ikan, moluska, serangga, invertebrata akuatik lain, dan tumbuhan air. Burung dan beberapa spesies migrasi lain di rantau ini mempunyai hubungan unik dengan ekosistem ini kerana ia adalah antara
kawasan yang digunakan sebagai tempat pementasan atau pemakanan di sepanjang jalan laluan migrasi mereka.

Sumber air tawar yang banyak di rantau ini menerima 9.5 peratus daripada jumlah jumlah hujan global setiap tahun, dan dikurniakan 16.2 peratus daripada jumlah sumber air yang boleh diperbaharui di dunia. Purata sumber air per kapita tahunan yang terdapat di rantau ini ialah 12,980 meter padu, kadar hampir dua kali ganda
daripada purata dunia.

Perairan pedalaman adalah sumber utama pengairan untuk kawasan pertanian di rantau ini.
Sektor pertanian menggunakan 85.5 peratus daripada jumlah pengeluaran air, diikuti oleh sektor perindustrian (7.8
peratus) dan sektor domestik (6.6 peratus). Kesejahteraan ekosistem dan manusia sangat
bergantung pada perkhidmatan ekosistem penting yang diberikan oleh ini.