Vùng nước nội địa hỗ trợ đa dạng sinh học thủy sinh phong phú chiếm gần 2 triệu km2 trong khu vực ASEAN, và điều này làm cho vùng nước nội địa trở thành một trong những môi trường sống tự nhiên đa dạng và có năng suất cao nhất. Vùng nước nội địa hỗ trợ một số thành phần của đa dạng sinh học thủy sinh bao gồm bò sát, lưỡng cư, cá, động vật thân mềm, côn trùng, động vật không xương sống dưới nước khác và thực vật nước. Các loài chim và một số loài di cư khác trong khu vực này có mối quan hệ độc đáo với hệ sinh thái này vì nó nằm trong số các
khu vực được sử dụng làm địa điểm dàn dựng hoặc kiếm ăn dọc theo con đường di cư của chúng.

Tài nguyên nước ngọt dồi dào của khu vực nhận được 9,5% tổng lượng mưa toàn cầu mỗi năm và có 16,2% tổng tài nguyên nước tái tạo của thế giới. Tài nguyên nước bình quân đầu người hàng năm có sẵn trong khu vực là 12.980 mét khối, một tỷ lệ gần gấp
đôi mức trung bình thế giới.

Vùng nước nội địa là nguồn tưới tiêu chính cho các khu vực nông nghiệp trong khu vực. Ng
ành nông nghiệp tiêu thụ 85,5% tổng lượng nước rút, tiếp theo là khu vực công nghiệp (7,
8%) và khu vực nội địa (6,6%). Sức khỏe của các hệ sinh thái và con người
phụ thuộc mạnh mẽ vào các dịch vụ hệ sinh thái quan trọng mà chúng cung cấp.