淡水生态系统存在于陆地水体中，可以是流动的、静止的，也可以是人造的。河流和溪流、湖泊和水库以及人工鱼塘就是分为三类的例子。所有这些都以从森林产生的天然雨水集水盆地流出的低盐度水为特征。

淡水生态系统为人们带来了许多实际好处，包括作为生活和工业用水的廉价便捷来源、自然废物处理系统和自然水循环的蓄水池。淡水体也可以用作运输路线。

这种类型的生态系统通常处于危险之中，因为需要排水才能满足渔业和农业的目的。