东盟地区拥有丰富的生物多样性，可以维持该地区和世界的基本生命支持系统。这种生物多样性支持生计和文化，对东盟内外数百万人的生存和福祉至关重要。生物多样性越来越受到全球和区域环境问题的威胁，例如气候变化、栖息地破坏、森林砍伐、污染、非法野生动物贸易、外来入侵物种、贫困和人口增长、执法不力、缺乏有效的保护措施等。采矿、伐木和捕鱼等采掘业往往采掘超出其极限的资源，并经常采用不负责任的商业行为来增加产量和利润。

世界自然基金会《2014年地球生命报告》确定，世界上60％以上的生态系统已经退化，无法再提供优质的商品和服务。尽管东盟很难评估整体生态系统退化的价值，但东盟生物多样性中心（ACB）于2012年进行的一项关于生态系统和生物多样性经济学的全区域范围研究指出，在一切照旧（BAU）情景下，预计红树林面积减少造成的生态系统服务价值损失每年为21.6亿美元（按2007年的价格计算）。就沿海和海洋生态系统而言，如果目前的过度捕捞速度和破坏性捕捞方法继续下去，预计在2000-2050年期间，每年损失56.4亿美元（按2007年的价格计算）。