Mặc dù chỉ chiếm 3% bề mặt trái đất, khu vực ASEAN tự hào về đa dạng sinh học trên cạn và biển đáng kể trên toàn cầu, bao gồm 18% tất cả các loài được đánh giá bởi Liên minh Bảo tồn Thiên nhiên Quốc tế (IUCN). Nó có các rạn san hô đa dạng nhất trên thế giới và là nơi sinh sống của các quốc gia đa dạng như Indonesia, Malaysia và Philippines. Khu vực này cũng trải dài một số đơn vị địa lý sinh học độc đáo như Ấn Độ-Miến Điện, Malesia, Sundaland, Wallacea và Trung tâm Thái Bình Dương. Để bảo vệ sự giàu có này, 10 quốc gia thành viên ASEAN, tất cả các thành viên của Công ước về Đa dạng Sinh học (CBD), đã cam kết vào năm 2002 thực hiện Mục tiêu Đa dạng Sinh học năm 2010: “đạt được mục tiêu đến năm 2010 về việc giảm đáng kể tỷ lệ mất đa dạng sinh học hiện nay ở cấp độ toàn cầu, khu vực và quốc gia như một đóng góp vào việc xóa đói giảm nghèo và mang lại lợi ích cho tất cả sự sống trên trái đất.” Báo cáo này, Triển vọng Đa dạng Sinh học ASEAN, xác nhận rằng khu vực này, giống như phần còn lại của thế giới, đang ngày càng mất đa dạng sinh học với tốc độ đáng báo động trong các hệ sinh thái khác nhau - rừng, hệ sinh thái nông nghiệp, đất than bùn, nước ngọt, rừng ngập mặn, rạn san hô và cỏ biển.